Después de que Gideon arrebata la Cabaña del Misterio a Stan, todo en Gravity Falls parece ser más raro aún. Dipper, Mabel y Stan son obligados a mudarse en la casa de Soos y su abuela, y toda la ciudad parece estar perdidamente atraída por los encantos de Gideon. La inseguridad de Stan de poder seguir cuidando a los niños le hará tomar la difícil decisión de enviarlos de vuelta. Dipper y Mabel buscarán recuperar la casa antes de que el verano acabe.
Los niños y Soos viajan a través de la mente de Stan para derrotar a un demonio sueño complicado llamado Bill Cipher, convocado por Gideon. Dipper también usa esto como una oportunidad para tratar de encontrar la razón por la que Stan es tan duro con él.
Pato es capturado por una criatura prehistórica tras ser descuidado por el Tío Stan. Mabel, al enterarse de su irresponsabilidad, se niega a hablarle. Al mismo tiempo, Dipper cree que Soos solo entorpecerá la misión para recuperar a Pato
Cuando Mabel descubre que su banda de chicos favorita es en realidad un montón de clones encarcelados, ella los libera, sólo para decidir quedárselos para sí misma. Mientras tanto, Dipper piensa que Robbie planea lavarle el cerebro a Wendy mediante un mensaje secreto oculto en la letra de una de sus canciones. Cuando él y Stan descubre que es verdad, tratan de detenerlo.
Soos descubre una habitación secreta en el interior la Cabaña del Misterio, y Dipper está feliz de reclamarlo como su propio espacio independiente, pero hay un problema: Mabel quiere la habitación también. Ambos compiten por la aprobación de Stan para ganar el cuarto, pero el concurso se vuelve aún más difícil cuando los hermanos cambian de cuerpo debido al misterioso poder de la alfombra de esa habitación.